March 14th, 2020

Птица

Ещё один мошенник от пост-науки продаёт страшный и ужасный коронавирус!

Некто shvarz почти верно пересказал китайскую статью про коронавирус, получил массу благодарности от просветлённой новым знанием публики, но когда ему стали задавать вопросы (потому что приврал при пересказе в том месте, которое он не понял и/или же специально приврал для соответствия заданному нарративу) — начал хамить и удалил все мои комментарии.
Ну, вот такой их интеллектуальный уровень.
Судите сами.
Вот эту ветку почистил полностью — можете сами оценить уровень его собственных комментариев. Кстати, это типичный представитель западной науки — агрессия и оскорбления как только им совершенно вежливо что-то отмечают такое, чего они переврали или достали непонятно откуда и когда им задают вопросы, на которые они в итоге не могут ответить. Тогда ниже отвечу за него.

И т.к. стиль мошенника мне знаком, то все существенные комментарии были мною сохранены. Привожу их здесь.
Collapse )
Увы — способности хамить нашего американского учёного™ оказались гораздо выше его интеллектуальных спобностей.
И потому оные утекшие за океан мозги меня в итоге забанили — мне же интересно было дать ссылочку на вышеуказанные чистки его благодарным фанам.

Мною потому и было указано на то, что вирус СНАЧАЛА детектировали с помощью готовых праймеров (из его прошлых версий), а ПОТОМ изолировали для дальнейшего изучения.
И что китайцы всё своё исследование отдизайнили так, чтобы найти именно штамм коронавируса — и только его!

Что касается почему нельзя автоматически убрать эти отсеквенированные кусочки РНК, которые надо собирать в последовательности и идентифицировать.
В статье этого нет, на что мною и указано — в статье нет НИЧЕГО конкретно про то, как именно из «компота» РНК в образцах убирали лишние организмы — наш мошеннник просто выдумал про оную «автоматическую» фильтрацию.
А это невозможно! Потому что в оном «компоте» будет очень-очень много ридсов (отсеквенированные кусочки РНК), часть которых вообще никуда не отмаппится — некуда маппить, нет записей в БД потому что это вообще неизвестные науке организмы.
Потому что мы далеко не всё знаем — как можно идентифицировать ещё неизвестные науке микроорганизмы!
И потому что при РНК секвенировании картина примерно такая:
90,7% всех считываний сопоставлены с геномом человека; 0,03%, 0,20% и 0,39% всех прочтений были отнесены к археальным, бактериальным или вирусным метафункциям, соответственно; и 8,6% всех чтений остаются неотличимыми на уровне видов
— источник: MetaMap: an atlas of metatranscriptomic reads in human disease-related RNA-seq data.
И невозможно «автоматически» убрать ридсы, которые неотличимы, потому что тогда невозможно собрать те, которые соответствуют новому штамму — 15% его РНК было отлично от известных штаммов и тоже неизвестна, согласно статье: потому вирус сначала детектировали, а потом изолировали и размножили его РНК (с помощью того же RT-PCR) для дальнейшего анализа и секвенирования, результатом которого было то, что уже большинство из 20 тысяч ридсов отмаппили на известный бетакороновирус: most contigs matched to the genome from lineage B of the genus betacoronavirus — showing more than 85% identity with a bat SARS-like CoV — мою цитату этого оный шварц тоже потёр. И это большинство, most contigs, из 20 тысяч ридсов всего насеквенированного от размноженного вируса никак не дотягивает до тех 8.6% от всех полных РНК в образцах (те неотличимые ридсы неизвестных организмов — это могут быть десятки миллионов ридсов, а не десятки тысяч) — которые можно было бы «автоматически» отбросить, если бы это было полное секвенирование всех РНК в образцах.
Нет, специально детектированный и специально размноженный вирус секвенировали отдельно: и нашли не случайно, не между прочим, а всё исследование было задумано для того, чтобы найти его и именно его — какой-то новый коронавирус, который изначально детектировался и размножался с помощью праймеров к другим штаммам такого же вируса.